L’église primitive de Vallabrègues s’écroule entre 1645 et 1667 suite à des crues du Rhône, le service divin est alors déplacé dans la chapelle des Pénitents Blancs (parcelle 491 du cadastre de 1812) dans l’attente de la construction d’un nouvel édifice.

Le choix des consuls s’oriente vers un réaménagement dans un édifice existant, sans doute par manque de moyens et de parcelles non-inondables. Une délibération consulaire témoigne de l’achat d’une maison (parcelle 426 du cadastre de 1812) appartenant au collège de la compagnie de Jésus de Montpellier le 30 janvier 1668. Cette maison seigneuriale en centre-ville, le domaine l’entourant ainsi que le puits et les vignes sont acquises par les Jésuites au seigneur Antoine de Clermont de Verteillac et à sa femme Anne de Pestel le 8 mars 1649 devant le notaire Perres.

Le remaniement à la fin du XVIIe siècle entraine une division de l’édifice en deux parties abritant ainsi la maison consulaire dans la partie gauche de l’élévation antérieure et l’église dans la partie droite.

La partie gauche de l’édifice a de multiples affectations : maison consulaire à la fin du XVIIe, elle devient la maison commune au début du XIXe siècle et en 1854 elle accueille la mairie jusqu’en 1881 ainsi que la maison école. Un document de 1858 précise que les deux parties de l’édifice communiquaient avant leur séparation par une cloison. Le local de l’ancienne mairie est occupé à partir de 1884 par le service des Postes. Les plans dressés pour l’aménagement intérieur du bureau témoignent de l’ajout d’un escalier à retour tournant à gauche et d’une division de la parcelle en trois affectations : le logement du garde à gauche, le bureau de poste au centre et l’église à droite. Ce logement correspond sans doute à celui du garde-champêtre Hippolyte Giraud, fonction créée le 3 brumaire de l’an IV pour la protection des récoltes et des propriétés rurales. L’église, réaménagée dans le dernier tiers du XVIIe siècle, est bénie par l’évêque d’Uzès. Le manque de documentation concernant les travaux d’aménagement ne permet pas d’en connaître les détails.

Un premier projet de réalisation d’un clocher pour 500 livres par le maçon Jean Fustier est mentionné dans les archives communales dès 1696, une cloche est alors consacrée en 1731. Le clocher actuel correspond au devis proposé en 1792 mais dont les travaux sont reportés en 1808 en raison de la révolution qui occasionne de nombreux dommages sur l’église. Les travaux, entrecoupés par la rigueur de l’hiver reprennent en juin 1809 pour 1620 francs. Le préfet approuve également à cette occasion l’achat d’une seconde cloche pour la somme de 1000 francs le 12 septembre 1808.

Le curé Portal précise dans sa lettre de 1826, avoir fait construire la tribune ainsi que la présence d’un passage souterrain communiquant avec le presbytère adjaçant (parcelle 486 du cadastre de 1812). Ce souterrain est aujourd’hui fermé.

À la fin du XIXe siècle, l’état de l’église se dégrade suite à des infiltrations d’eau, l’architecte Claude Mery est consulté en 1883 pour effectuer des réparations sur la toiture et les dalles. Le devis initial s’élève à 2731,80 francs auxquels viennent s’ajouter 471,04 francs de dépense supplémentaire. Le ministère de la justice et des cultes apporte un secours de 2500 francs. Le plan dressé par cet architecte témoigne de l’existence d’un volume quadrangulaire opposée à la sacristie par symétrie axiale du choeur ; il n’est plus présent aujourd’hui.

La toiture de l’église et de l’hôtel des postes s’écroule en partie le 9 décembre 1922. La commune fait appel à un architecte de Beaucaire pour réaliser sa réfection qui s’élève à 13000 francs et obtient un secours de la commission départementale de 4000 francs. Les tuiles utilisées proviennent des usines de Marseilles et de Théziers.

À la fin du XXe siècle un contrefort en béton partant de la base du clocher sur l’élévation latérale gauche est ajouté. Au début du XXIe siècle des travaux d’aménagement de la place entrainent la disparition des escaliers menant à l’église ainsi qu’à la poste.