Oeuvre datée entre la seconde moitié du 12e siècle et le début du 13e siècle.
L'autel semble être celui qui est cité dans les archives, qui notent "un petit autel de saint Guilhem", situé côté sud du maître-autel, jusqu'en 1679.
Oeuvre remise à l'honneur par l'abbé Léon Vinas, présent à Saint-Guilhem entre 1841 et 1848. Les trois panneaux antérieur et des côtés ont été trouvés près du mur nord du transept, tandis que la table d'autel servait comme marche, à l'autel de la croix. Il fit reconstituer à cette époque un autel.
En 1990, après restauration, l'autel est placé dans la chapelle sud de l'église. En 2013, une nouvelle intervention est engagée, appuyée sur des analyse scientifiques permettant d'étayer l'intervention du restaurateur. En 2018, l'oeuvre est placée dans le sanctuaire de l'église.
