La collection de minéralogie actuellement présentée dans le musée de l'institution Saint-Joseph de Rodez est l'oeuvre du Frère Clément Baute. Ayant repris le travail du Frère Arènes, c'est lui qui a organisé cette collection dans les années 1930. L'exposition a subi quelques changements après la mort du Frère, en 1971. Des pièces ont été ajoutées - les roches apportées par le frère Viguier datent de 1975 - alors que d'autres ont été rangées dans les tiroirs des armoires. La présence de différents cartels pour un même objet témoigne également de cette évolution, de même que d'anciennes étiquettes conservées dans les tiroirs.£En outre, un inventaire sommaire, établi vers 1959 et publié dans l'ouvrage fêtant le centenaire de l'institution, révèle qu'à cette date ""le Musée [avait] rassemblé 400 échantillons de roches éruptives, 600 échantillons de roches alcalines, 120 plaquettes de coquilles de mollusques, 142 plaquettes pour les gastéropodes, 172 plaquettes pour les lamellibranches"" . L'inventaire conservé dans les archives du musée - à savoir des feuilles volantes glissées dans des emballages de papier canson, elles-mêmes rangées dans les tiroirs des vitrines - et datant certainement des années 1990, fait état de davantage de pièces pour la minéralogie et la conchyliologie. Ce catalogue correspond très certainement aux objets encore en place : aujourd'hui plus de deux-mille pièces minéralogiques et près de mille coquillages sont conservés au sein du musée.£La constitution de la collection est d'abord l'oeuvre des frères de l'institution et des frères appartenant à d'autres établissements. Plusieurs pièces proviennent de l'Aveyron et des départements voisins (Lot, Cantal). D'autres éléments ont été donnés par des connaissances, notamment le directeur des usines de Viviez ou encore Eugène Salesse, ancien élève de l'établissement, ayant participé à la construction du chemin de fer Le Caire - Niamey et donateur de la collection de minéralogie entreposée dans l'un des couloirs de l'établissement. Des cartels rappellent que quelques roches proviennent également du territoire national (Bretagne) et des anciennes colonies françaises (Sahara Oriental, Madagascar, Nouvelle-Calédonie). Enfin, la présence d'une facture quant à l'achat de roches prouve que certaines ont été commandées spécialement pour le musée, de même que les petits meubles se trouvant sous le plan-relief de la région de Rodez font parfois mention du comptoir géologique et minéralogique d'Alexandre Stuer, à Paris, rappelant les liens qui existaient entre les frères collectionneurs et les réseaux de géologues. Les pierres ou les meubles ont pu y être achetés.£Par ailleurs, une collection de fossiles a été déposée par le musée de Millau en 1967-1968 afin d'être inventoriée par le Frère Laur. Cette anecdote montre que les frères étaient sollicités pour leurs connaissances.