La chapelle a été construite entre 1783 et 1786 à l'emplacement du portique d'entrée de l'église. Elle n'a reçu son décor actuel qu'aux environs de 1843, sous le patronat du curé Reuil.
Des tractations entre la commission archéologique de Narbonne et la fabrique ont lieu à cette époque pour rendre à Narbonne un tableau qui représente Saint Charles Borromée administrant la communion aux pestiférés de Milan, est présent dans l'église de Gruissan (voir présentation du mobilier). A la suite de ces échanges, La chapelle de la Vierge se voit alors dotée de tout un décor sculpté, en particulier deux statues en bois (saint Joseph et saint Dominique) sur lesquels Loubau consent une forte réduction en dédommagement du tableau (Commission archéologique de Narbonne, 1846.