La voûte de la chapelle dédiée à saint Joseph comporte au centre un médaillon où figure un Christ glorieux, tenant dans sa main gauche un lys. Dans les quatre quartiers sont représentées de manière allégorique les vertus théologales : la Foi, la Prudence, l'Espérance et la Pureté. Différents attributs permettent leur identification : le calice et le coeur enflammé caractérisent la Foi, le lys la Pureté, le miroir la Prudence tandis que l'ancre et l'étoile caractérisent l'Espérance. Elles sont entourées d'anges tenant dans leurs mains des phylactères et des cartouches. Au-dessus apparaissent d'autres anges qui portent des fleurs et des palmes. Sur le mur oriental est mise en scène la mort de saint Joseph. La présence de la Vierge Marie, de Dieu le Père et du Saint Esprit renvoie à la représentation habituelle de cette scène. Le personnage de Joseph n'est que partiellement visible. Il n'est pas improbable que la figure de Jésus ait été présente et qu'elle ait disparu lors de la modification de la fenêtre. On note également la présence d'anges musiciens, dont un joue du violoncelle. Dans la chapelle de la Vierge ne subsistent plus que deux anges tenant l'un un miroir, l'autre un lys, ainsi que la Vierge d'une Annonciation. Le décor d'accompagnement est constitué de faux-marbres, de moulures enrichies de modillons et d'oves en trompe-l'oeil, de fausses-tentures, de faux-lambris...

Les inscriptions accompagnent les Vertus. La Foi : Iustus ut palma florebit ("Le juste s'épanouira comme un palmier", Psaume 91, 13) et une deuxième inscription peu lisible qui n'a pas été identifiée ; la Pureté : Incorruptio facit esse proximum deo ("L'incorruptibilité nous rapproche de Dieu", Sagesse 6, 20) et : Qui vicerit sic vestietur (Ainsi celui qui vaincra sera-t-il vêtu", Apocalypse 3, 5) ; la Prudence : Estote prudente sicut serpentes ("Montrez-vous prudents comme les serpents", Matthieu 10, 16) ; l'Espérance : Spe salvi facti sumus ("C'est en espérance que nous avons été sauvés", Romains 8, 24). (Les références sont celles de la Vulgate.)

Les peintures ne subsistent plus qu' à l'état de vestiges dans la chapelle de la Vierge. Celles de la chapelle Saint-Joseph présente d'importantes lacunes ; la scène de la Mort de saint Joseph a été en partie détruite par l'agrandissement de la fenêtre. L'ensemble a été restauré à la fin des années 1970 et au début des années 1980.