L’église Notre-Dame était celle d’une abbaye attestée au VIIIe siècle, dépendant depuis le XIIe siècle du chapitre cathédral de Toulouse, avant son érection en cathédrale par le pape Jean XXII en 1317. Probablement motivée par ce changement de statut, sa reconstruction entreprise avant 1336 fut achevée dans le courant du XVe siècle, selon une chronologie qui demeure peu précise (cf. Mesplé, 1970). L’édifice à deux nefs de dimensions inégales, l’une et l’autre terminée par une abside polygonale et élargie d’un rang de chapelles, conserve des vitraux du XVIe siècle dans huit de ses fenêtres.£Cinq verrières demeurées à leur emplacement d’origine dans les fenêtres hautes du flanc sud figurent d’est en ouest la Descente du Saint-Esprit (baie 102) et les Évangélistes occupés à écrire (baies 104 à 110). Ces représentations hautement colorées, aux formes puissantes, sont abritées de dais flamboyants dont le vocabulaire, s’il rappelle celui employé dans l’une des verrières de la cathédrale d’Auch (baie 17), apparaît ici sous une forme très simplifiée. Alexandre Du Mège et Ernest Lami de Nozan ont tôt attribué les vitraux de Lombez à Arnaud de Moles, mais rien ne permet de souscrire à leur opinion lorsqu’on examine cette production d’un art bien moins raffiné que l’ensemble d’Auch, même si elle est contemporaine ou de peu postérieure. Une inscription lisible au bas de la baie 102 indique que ce groupe de baies a été restauré en 1905 par le Bordelais Henri Feur.£Les trois lancettes du fond du chœur (baies 0, 1 et 2) regroupent d’autre part des vestiges de verrières légendaires relatives à la Passion et à la Vie de la Vierge, dont l’arrangement résulte de la restauration pratiquée en 1892 par le peintre verrier toulousain Amédée Bergès, qui les a largement complétés. L’état précédent de ces vitraux, où se retrouvent certains caractères de la série mieux conservée des fenêtres hautes, est documenté par Ferdinand de Guilhermy, qui les a décrits en 1857. Les scènes qui formaient un ensemble très mutilé étaient réparties au sommet des cinq fenêtres de l’abside principale dont le bas avait été muré. En baie 3 était conservé un morceau du Portement de croix (disparu) et l’Entrée à Jérusalem maintenant remontée en baie 1, sous la Nativité et la Fuite en Égypte que l’érudit passe sous silence parce qu’elles devaient être méconnaissables. Ladite baie 1 était à l’époque occupée par les fragments de deux des Comparutions du Christ depuis transférés en baie 2, sous les restes de la Mise au tombeau et de la Résurrection qui y sont demeurés. La baie 4 hébergeait la Présentation de la Vierge au temple aujourd’hui déplacée au milieu de la baie axiale. La Crucifixion, déjà en place en haut de celle-ci, dominait alors « un panneau mutilé » au-dessus de la représentation de « deux évêques se parlant », isolée par « divers morceaux rapportés » des « deux écussons » encore visibles au soubassement. L’écu de droite a depuis été reconnu comme celui de Jean de Bilhères de Lagraulas, titulaire de l’évêché de 1473 à son décès en 1499, devenu abbé de Saint-Denis en 1474 et promu cardinal en 1493 (cf. Samaran, 1921, p. 92). L’écu voisin, aux meubles héraldiques en partie semblables, désigne son neveu et successeur Denis de Bilhères, remplacé en 1513 par Savaric d’Ornézan. Accolée depuis 1892 à ces armoiries, à bon escient d’après leur technique commune, la figuration des deux évêques conversant autour d’un autel passe pour un portrait des deux prélats, le second étant considéré comme le commanditaire des vitraux de l’église, ce dont il est permis de douter. L’image dérogerait en effet aux codes de représentation des donateurs et, surtout, la chape fleurdelisée du personnage de gauche permet d’identifier saint Louis d’Anjou. La signification de la scène doit plus sûrement être recherchée dans la légende de ce franciscain canonisé par Jean XXII le 17 avril 1317 après un procès instruit par les évêques de Saintes et de Lectoure. Cette partie de verrière, d’une facture plus délicate et d’échelle plus réduite que les panneaux du cycle christique, doit avoir été rapportée ici ; elle pouvait garnir l’une des chapelles latérales si ce n’est la chapelle absidale de la nef nord où, en 1865, Marcelier de Gaujac mentionnait des vitraux dont « les panneaux inférieurs ont été enlevés et remplacés par du verre blanc pour donner plus de jour au chapitre ». L’abbé Cazauran signalait d’ailleurs en 1889 au chevet de la nef secondaire une « verrière sacrifiée pour compléter celles qui se trouvaient en meilleur état » lors d’une campagne antérieure à celle de 1892 (monographie paroissiale manuscrite, citée par Lagaeysse, 1988, p. 433). Il apparaît en tout cas clairement que le programme primitif, très amoindri au fil du temps, avait subi de drastiques altérations avant la restauration de la fin du XIXe siècle. Suite au débouchage de la partie inférieure des fenêtres, Bergès a donc regroupé ce qui subsistait dans les trois baies centrales du chœur en y introduisant force compléments. Il a en même temps exécuté des grisailles pour les baies 3 et 4, et renouvelé le vitrage de la chapelle absidale de la nef nord (baie 5, la Vierge immaculée, l’Annonciation et la Visitation, signée et datée de 1892 ; baie 7, grisaille).£Guilhermy fait également mention de vitraux disparus après 1857, par exemple une sainte Anne fragmentaire dans la première chapelle nord du côté ouest. On peut encore déduire de ses notes que l’un des trois évêques de la famille Daffis qui se succédèrent de 1597 à 1657 à Lombez avait fait placer ses armoiries dans les vitres blanches de deux baies (non localisées). L’érudit, qui datait « du XVII ou du XVIIIe siècle » l’écu deux fois reproduit dans chacune « avec palmes, mitres et crosses », en donne en effet une description conforme à celui qui timbre la verrière offerte en 1612 par Jean Daffis à la cathédrale de Toulouse (cf. notice, baie 103). Ces panneaux perdus ont manifestement inspiré les blasons épiscopaux teintés d’émaux qui ponctuent les oculi percés au-dessus des chapelles nord (baies 101 à 107) : exécutés à la fin du XIXe siècle dans le style du XVIIIe, ces écussons placés au milieu de bornes figurent les armoiries de Charles Guillaume de Maupeou (1721-1751), d’argent au porc-épic de sable, et celles de son successeur Jacques Richier de Cerisy (1751-1771), de sinople à la bande d’argent côtoyée de deux cotices de même, et au lion passant d’or en chef ; le troisième reprend les armes des Daffis sans en respecter les couleurs, et le quatrième a été remplacé au XXe siècle par un fermaillet.