La collection de minéralogie est conservée dans plusieurs meubles à tiroirs classés et identifiés. Les tiroirs sont au nombre de 25. Les roches sont classées ainsi : silice ; tectosilicates, feldspaths, phyllosilicates ; pyroxène, épidote, amphibote, oviline ; éléments natifs de sulfures ; oxydes halogénures ; carbonates, phosphates, sulfates ; roches grenues et microgrenues ; syénites, diorites, gabbros ; roches volcaniques microlithiques ; roches vitreuses et produits de projections ; roches salines ; roches argileuses ; calcaires d’origines organiques ; calcaires caractérisés par leur structure ; calcaires impurs et marbres ; roches détritiques ; roches siliceuses ; roches charbonneuses.

Les collections sont généralement présentées dans des boîtes en carton, quelques boîtes en plastique, une fiole en plastique avec couvercle à vis, une fiole en verre scellée par un bouchon en liège et le reste est sans contenant, placé directement dans le tiroir. Les collections sont généralement identifiées. Certaines roches ne possèdent pas d'identification et non pas pu être identifiées lors de cet inventaire. Certains minéraux ont fait l'objet d'une étude par le Bureau de recherches géologiques et minières (B.R.G.M).

Deux boîtes d'échantillons pétroliers sont présentes dans la collection dans le tiroir des roches charbonneuses : une boîte en bois et une boîte en carton. La boîte en bois s'ouvre sur une affiche collée au couvercle. Elle explique les différents processus de fabrication du pétrole et de ses dérivés. Dans le couvercle droit, des fioles en verre présentant différents liquides : essence, pétrole lampant, gasoil, fuel léger, fuel lourd, huiles et graisses, paraffine, bitume et pétrole brut.

La collection est complétée par d’'autres minéraux retrouvés dans différents tiroirs du laboratoire de biologie mais non classés. Ils sont conservés soit dans les tiroirs, généralement sans étiquette d'’identification, soit dans des boîtes en carton dans des boîtes Deyrolle, enroulés dans du papier journal. Ces minéraux devaient servir au professeur pour les examens.

La collection de minéralogie comporte également un ensemble de lames minces de roches conservés dans un tiroir. Elles sont identifiées par classe.