Baie 0 : Vie de saint Jean-Baptiste. De haut en bas. Scène 1 : Une femme nimbée est étendue sur un lit. Devant le lit, une autre femme debout lui présente un bébé emmailloté. Scène 2 : La fuite de sainte Elisabeth au désert. La sainte, partiellement cachée par une capuche, est assise devant un arbre et tient un globe crucifère. Scène 3 : le Baptême du Christ. Scène 4 : Salomé danse devant Hérode

Baie 1 : Parabole du Bon samaritain : de haut en bas. Scène 1, un voyageur descendant de Jérusalem à Jéricho. Un personnage, sac sur le dos, marche en prenant appui sur un bâton. Scène 2, le voyageur est assailli par des bandits. Scène 3, un prêtre et un lévite passent, détournent les yeux et suivent leur chemin : le voyageur, assis au pied d'un arbre, est entouré de plusieurs silhouettes. L'un est mitré, barbu, tenant un long bâton ; l'autre, mains jointes, est dissimulé sous une capuche pointue. Scène 4, le Bon Samaritain s'approche du voyageur au pied de l'arbre. Scène 5, le bon samaritain et le voyageur chevauchent une mule et se dirigent vers l'hôtellerie la plus proche.

Baie 2 : Parabole de l'Enfant prodigue. De bas en haut. Scène 1, deux personnages : le plus jeune est debout, porte un sac et une bourse, l'autre, barbu, visiblement plus âgé est assis sur un lit à baldaquin. Scène 2, un berger garde son troupeau devant quelques arbres stylisés. Scène 3, scène de taverne : un personnage vêtu d'une blouse et d'un bonnet est assis à une table, tenant dans chaque main une horloge. Scène 4, un personnage féminin, vêtu d'un long manteau, lève les bras devant un petit personnage à moitié nu. Scène 5, le retour de l'Enfant prodigue. Deux personnages vêtus de longs manteaux à capuche ont les bras levés au ciel en signe d'accueil d'un petit personnage agenouillé.

Baies 3 et 4 : Verrières ornementales.

Baie 5 : saint Pierre. En bas : la vocation de saint Pierre et de saint André. Au premier plan, un filet de poissons est accroché à la barque devant laquelle est figuré Jésus. A centre : la remise des clés à saint Pierre. Jésus est debout, légèrement courbé vers Pierre agenouillé. Il lui remet les clés. En haut : la Crucifixion de saint Pierre.

Baie 6 : Les 3 archanges. En haut, Raphaël et la pêche miraculeuse du jeune Tobie. Au centre, l'Annonciation avec l'archange Gabriel. En bas, Michel combattant le dragon.

Baie 7 : Les champs Elysées. 2 personnages sont allongés face à face avec des figures qui jouent de la cithare. Au centre de la composition, un personnage mitré est assis sur un trône fleuri et tient aussi un instrument de musique. En partie basse, un phylactère.

Baie 8 : La naissance de la Vierge. 4 personnages assistent à l'évènement. 2 sont debout et un autre est assis au premier plan sur les marches d'un escalier. Les 3 compartiments inférieurs représentent des symboles des litanies de la Vierge : la tour de David, la tour d'ivoire de part et d'autre de la rose mystique.

Baie 9 : La Résurrection des morts. En partie basse 3 groupes de personnages mitrés ou couronnés sont superposés verticalement, allongés ou assis dans une barque. Ils sont dominés par un ange aux ailes déployées qui brandit une faux.

Baie 10 : L'Assomption. Le corps de la Vierge est soulevé dans les airs par 3 anges blancs aux grandes ailes déployées.

Baie 11 : La Descente aux Enfers. Charon est assis dans une barque vers laquelle converge un cortège de condamnés qui descendent d'un escalier à l'arrière plan. Des vautours et des dragons voisinent avec 3 personnages au sommet de la composition. En partie basse un phylactère.

Baie 12 : Le mariage mystique de la Vierge. Au centre de la composition, Marie et Joseph debout se font face. Ils sont entourés du prêtre mitré et mains jointes et de sainte Anne et saint Joachim. La partie basse du vitrail montre deux files de personnages en procession vers le centre de la composition. L'inscription reprend l'hymne des vêpres, dans le Petit paroissien romain.

Bas-côté sud. Baie 14 : Marie Madeleine. De haut en bas, les 4 premiers médaillons sont consacrés à Marie de Magdala : Marie Madeleine possédée par les démons, la pècheresse repentie, un jour chez Simon, Marie Madeleine et ses cheveux épais… Les 3 autres font référence à Marie de Béthanie, soeur de Marthe et de Lazare.

Bas-côté nord. Baie 15 : Le prêche de saint François d'Assise aux poissons. Au centre de la composition, saint François est debout, les bras tendus vers les poissons.

Bas-côté sud. Baie 16 saint Julien l'Hospitalier : De bas en haut et de gauche à droite. Scène 1, en bas à gauche : la naissance de Julien. Un château couronné de tours, 1 personnage féminin étendu sur le sol et un autre barbu, debout, les bras levés. Scène 2, en bas à droite : saint Julien en train de chasser. Scène 3, au-dessus à gauche : le massacre des cerfs. Scène 4, à droite : la prédiction du cerf. Scène 5, au-dessus à gauche : les funérailles des parents de saint Julien. Scène 6, à droite : le passage du fleuve avec le lépreux. Scène 7, au sommet : saint Julien emporté dans le ciel par le Christ.

Bas-côté nord. Baie 17 : Le sermon de saint François d'Assise aux oiseaux. Décor d'architecture avec saint François au centre de la composition. 5 chandeliers de taille décroissante sont figurés au premier plan.

Bas-côté sud. Baie 18 : Légende de saint Nicolas. Panneau central : la Résurrection des 3 enfants jetés au saloir. Saint Nicolas, en habit violet, reconnaissable à sa crosse, accueille les 3 enfants qu'il vient de ressusciter. En haut : Saint Nicolas accueilli par des anges après sa mort. En bas : la Charité de saint Nicolas. Un personnage féminin est allongé sur un lit entre deux chandeliers. Le saint plane au-dessus d'elle. A droite : saint Nicolas patron des marins. A gauche, saint Nicolas appelé à l'évêché de Myre.

Bas-côté nord. Baie 19 : Le sermon de saint François d'Assise aux oiseaux. Décor d'architecture avec saint François au centre entre les piédroits de l'arcade. Debout et de face, il se détache sur un fond vert et tend les bras vers le ciel. Les oiseaux sont groupés à ses pieds.

Bas-côté sud. Baie 20 : lancette gauche, de haut en bas : sainte Thérèse d'Avila saint Eugène, sainte Adélaïde, lancette de droite : sainte Colette de Corbie, saint Bertrand (?), sainte Geneviève.

Bas-côté nord. Baie 21 : Le sermon de saint François d'Assise aux oiseaux. Décor d'architecture avec des formes plutôt abstraites d'oiseaux rouges, jaunes, violets et blancs. Présence de branchages.

Bas-côté sud. baie 22 : lancette droite, panneau du haut : personnage féminin, les bras levés, assailli par des formes abstraites. Panneau central, saint Alban, représenté en jeune soldat, nimbé et les mains jointes. Panneau bas : un personnage féminin debout semble tenir dans ses bras une châsse reliquaire. Lancette gauche, panneau du haut : personnage féminin dans une mandorle, panneau central : saint Paul. Panneau du bas : sainte Cécile ?

Bas-côté nord. Baie 23 : saint François d'Assise recevant les stigmates du Christ. Au premier plan, entre les piédroits de l'arcade le saint, vêtu d'une robe de bure est agenouillé. Des rayons lumineux émanent de la représentation d'un crucifix.

Bas-côté sud : baie 24 : lancette gauche, panneau du haut : sainte Germaine de Pibrac ; panneau du bas : saint André ; lancette droite, panneau du haut : sainte Marguerite, panneau du bas ; saint René.

Elévation orientale, partie médiane. Baie 101 : sainte Élisabeth de Hongrie, représentée en pied sans encadrement architectural. Debout, de face, la tête baissée, elle tient une rose dans chaque main : allusion sans doute au miracle des roses.

Elévation orientale, partie médiane. Baie 102 : saint Antoine est figuré debout sous une arcade en plein cintre soutenue par de minces piédroits. Mains jointes, vêtu d'une robe de bure avec une capuche, il est nimbé. Au-dessus sont imités des jours, de forme tréflée. Ainsi le tympan permet la représentation de 3 scènes de la vie du saint : La tentation au désert, le saint transporté au paradis par des anges, la visite de saint Antoine à Saint Paul Ermite

Elévation orientale, partie haute. Baie 200 : le Christ et les quatre évangélistes. Chaque personnage prend place sous une arcade trilobée surmontée de 3 petites tours. Chacun se détache sur un fond coloré. Au centre le Christ se distingue des personnages voisins par ses bras levés, les mains et les pieds marqués par la crucifixion et le nimbe crucifère. Conçus sur un modèle identique, saint Mathieu et saint Marc se présentent de face alors que saint Jean et saint Luc tournent leur tête vers le Christ central. Dans les jours tympan sont figurés les symboles des évangélistes. On remarque que les symboles de saint Mathieu (lion) et de saint Jean (aigle) ont un emplacement inversé.

Elévation orientale, partie haute. Baies 201 et 202 : saint Léon pape et saint Simon. Saint Léon est représenté de face. Il est barbu, vêtu d'un riche manteau, coiffé d'une tiare et fait un geste de bénédiction. Derrière lui de grands faisceaux rouges coupent le font vert. Saint Simon est représenté sous des traits juvéniles et féminins. Représenté de face, les mains jointes et vêtu d'un riche manteau, il est nimbé.).

Transept. Baies 203 et 204, roses ornementales.

Elévation ouest. Baie 103 : symboles de l'Apocalypse de saint Jean. Lancette gauche, de haut en bas : panneau 1 : Première théophanie. Sur un fond bleu clair, les sept chandeliers jaunes au milieu desquels apparaît un calice rayonnant ; panneau 2 : le message à l'église d'Ephèse. Sur un fond indigo, parsemé de nuages blancs, figure l'arbre de vie avec des fruits orange ; panneau 3 : Seconde théophanie. Une porte ouverte d'où émane une lumière blanche est représentée sur un fond bleu. Panneau 4 : le trône de Dieu. Lancette droite, de haut en bas : panneau 1 : le tétramorphe : autour du médaillon central sont représentés des animaux marins : un poisson double et crochu, une écrevisse, un crabe et un animal non identifié ; panneau 2 : Troisième théophanie, le livre aux 7 sceaux : panneau 3 : les 4 cavaliers, médaillon divisé par 4 rayons concentriques blancs sur un fond bleu entre lesquels sont esquissés 4 cavaliers sur un cheval ; panneau 4 les 4 anges. Sur le médaillon, 4 anges bleus aux ailes blanches sont disposés autour d'une forme tourbillonnante verte.

Elévation ouest. Baie 104 : symboles de l'Apocalypse de saint Jean. Lancette gauche, de haut en bas : panneau 1 : La Dame sur le croissant de lune. Dans le médaillon central un personnage féminin nimbé avec la lune à ses pieds : panneau 2 : Le Dragon. Sur un fond blanc, le dragon de couleur rouge surmonté de tentacules ; panneau 3 : les deux bêtes ; panneau 4 : la colère divine : un petit temple très coloré au-dessus d'une crevasse dans laquelle tombent des coupes blanches. Lancette droite, de haut en bas, panneau 1 : le châtiment de Babylone : une silhouette féminine aux cheveux rouges est montée sur une bête verte ; panneau 2 : la chute de Babylone : au centre un tourbillon vert et mauve ; panneau 3 : le sort du dragon, dans le médaillon central, deux grands pics brun et blanc avec au centre deux formes vertes représentent le diable et Satan jetés dans l'abîme. Panneau 4 : la Jérusalem nouvelle

Elévation ouest. Baie 205, rose de la Création du monde. Dieu, au centre fait penser à une sorte de bouddha avec sa mandorle, autour de lui les jours de la création, séparés par des anges dos à dos : tout autour sont figurés les signes du Zodiaque, pour symboliser l’univers.

Baie 7 : inscription : "pange lingua mysterium".

Baie 8 : inscription : "nativitas tua gaudium annuntiavit mundo".

Baie 11 : inscription "descendit ad inferno"

Baie 12 : inscription : "junctus es inclytæ Casto foedere Virgini".

Baie 13 inscription : "la prédication aux poissons", signature.

baie 15 : inscription : "LA PREDICATION AUX POISSONS"

Baies 17 : inscription : "QUI VOUS A COUVERTS DE SI BELLES PLUMES"

Baie 19 : inscription : "GRAND SUJET DE LOUER VOSTRE CREATEUR"

Baie 20 : inscriptions concernant l'iconographie : "STA THERESIA" ; "ST EUGENIUS" ; "STA ADELAIDA" ; "STA COLETA" ; " ST BERNARDUS" ; "STA GENEVIEVA"

Baie 21 : inscription : "MES FRERES LES OISEAUX VOUS AVEZ GRAND"

Baie 22 : inscriptions concernant l'iconographie : "ST PAULUS" ; "ST ALBANUS"

Baie 23 : inscription : "SAINT FRANCOIS RECOIT LES STIGMATES", daté (?) et signé.

Baie 24 : inscriptions concernant l'iconographie : "STA GERMANA", "ST ANDREAS", "STA MARGARITA", ST RENATUS"

Baie 101 : inscription : "ST ELISABETH"

Baie 102 : inscription : "ST ANTOINE"

Baie 200 : inscriptions concernant l'iconographie : "INRI", "MATEUS", "IOHANN", "LUCAS", MARCUS"

Les verrières ont fait l'objet de plusieurs restaurations. Henri Bigot dans les années 1980 puis Pierre Rivière.

Constat est fait de l'atmosphère d’humidité moite très insalubre de l'église. Il est préconisé une meilleure ventilation. Le traitement des problèmes de fissuration de la masse vitreuse allant jusqu’à la fissuration totale, est envisagé par l'usage de collages. Est aussi observée une contamination biologique par algues et lichens extrêmement active, surtout sur le côté nord de l’abbatiale : l'altération des jus externes mêlés aux algues est avancée, tandis que la grisaille se décolle en face interne.

Si les mises en plomb sont correctes, Pierre Rivière s'inquiète des traces de rouille nombreuses, peut-être liées au décapant utilisé pour la soudure ? Les serrureries, en revanche, très hétéroclites, sont à réviser (Archives DRAC LR, CRMH, carton 1775), mais le nettoyage des verres et leur consolidation, le fixage des grisailles, le traitement par fongicide, la reprise de la mise en plomb et de la serrurerie s'accompagnera de la pose de doubles verrières en mise en plomb simplifiée. L'étude d'un protocole se poursuit en 2002-2003 sous la direction du LRMH avec test de consolidation des verre à l’aide du Paraloïd B72 et recherche de l'origine du vieillissement particulier des verres de Burgsthal (Archives DRAC LR, CRMH, carton 1031).