Le 10 février 1936, un arrêté municipal dessine les contours du projet de funiculaire reliant Barèges au plateau du Lienz pour développer les pratiques hivernales. Le devis doit alors être fourni par la Société anonyme pour l'aménagement et l'extension de Barèges (SAAEB), fondée le 2 octobre 1935, avec laquelle la Ville signe un bail de 40 ans. L'inauguration a lieu le 23 février 1936 et est l'occasion d'un grande manifestation sportive (La Dépêche, 23 janvier 1936).

Un mémoire daté du 25 février 1936 précise que le funiculaire est destiné au transport de voyageurs jusqu'à une point dit ""Croissant de l'Allée verte"", centre de convergence de nombreuses pistes et chemins à 1 540 m d'altitude, c'est-à-dire au niveau du plateau du Lienz. Le projet, envisagé depuis les années 1920 est soutenu par le Syndicat intercommunal de la vallée de Barèges, le conseil municipal, la chambre d'industrie thermale de Barèges, le syndicat d'initiative de Barèges et le club alpin français. Le point de départ prévu initialement se situait, pour des raisons économiques, sensiblement plus haut au niveau de la partie supérieure de l'Hospitalet. La pente et la direction de l'ouvrage étaient néanmoins prévues pour permettre de le continuer jusqu'à la promenade horizontale, puis jusqu'au bourg, en bordure de route nationale, quand les conditions économiques le permettraient. Les 220 m de dénivelés devaient être franchies par une voie de 640 m avec une pente moyennne de 45 cm par mètre. Par économie, le funiculaire est à voie unique (avec 1 m d'écartement), une voie d'évitement étant envisagée en fonction de la fréquentation. La voie est surélevée par rapport au sol pour favoriser le déneigement et ne pas créer de ravin les jours d'orage. En 1942, la ligne permettait de gravir 400 m en 9 minutes (Marche, 20 janvier 1942).

Le funiculaire est prolongé après-guerre jusqu'à l'Ayré, à 2 020 m d'altitude et doit être mis en service à l'hiver 1947-48 (Sports de neige et de glace, 1er juin 1947). L'article précise qu'un téléphérique entre l'Ayré et la Glaire sera mis en service et qu'un remonte-pente est en construction au Lienz, non loin du tremplin de saut. Un garage communal doit être construit et un hôtel (non réalisé) est même projeté au Lienz. Cette extension jusqu'à l'Ayré, avantageuse pour le développement touristique de la station, l'était également pour EDF qui, dans le cadre de ses aménagements hydro-électriques, tenait à desservir le lac de la Glère, vers lequel elle prolonge le funiculaire par un téléphérique pour y acheminer les équipes et le matériel nécessaires à la construction d'une station de pompage souterraine. Ce téléphérique mesurait 1 100 m de long sur 500 m de dénivelés (Sports de neige et de glace, 1er février 1947). L'ingénieur d'EDF, Marcel Lavedan, joua un rôle important dans ce projet. L'extension est intégralement financée par EDF qui a besoin d'accéder au site de la Glère jour et nuit et par toute saison. La disposition en viaduc des années 1930 a été reprise pour se prémunir des conditions météorologiques, un évitement est cette fois aménagé. Les travaux sont achevés en janvier 1949 et la ligne est mise en service en mars : fonctionnant jour et nuit pour le chantier EDF, le funiculaire est rétrocédé à 1953 à la commune. Il dessert alors une des pistes les plus renommées des Pyrénées et un gare est établie à l'arrivée en contrebas du pic de l'Ayré. En 1950, la gare d'arrivée, à 1 800 m d'altitude, est encore en construction.

Le funiculaire est l'objet d'une importante rénovation en 1977 qui concerne les voies, l'ensemble treuil et les cabines ce qui permet de les agrandir et de les rendre plus confortables. Le funiculaire a cessé de fonctionner entre 1990 et 1995 pour une nouvelle rénovation de sa machinerie. En 1996, 63 000 passages ont été enregistrés, dont plus de 10 000 en été (Pyrénées, oct 1998, p. 145). L'exploitation se poursuit jusqu'en 2000 où la mise aux normes demande des fonds trop importants pour la régie municipale.

Depuis 2010, l'association Funitoy porte un projet de remise en service et de réhabilitation du site de l'Ayré. Elle a réuni une important documentation sur le funiculaire qu'elle met à disposition sur un site consacré au remontées mécaniques.