Fils de Pierre-Adolphe Daguin(1814-1884), professeur de Physique de la Faculté des Science de Toulouse, Emile Daguin a longtemps gravité autour du milieu scientifique toulousain. En 1867, il devient aide-astronome à l'Observatoire de Toulouse sous la direction de son père. Il entame une carrière de professeur de Lycée à Rodez, Tardes, Bastia puis enfin Bayonne, où il enseigne pendant trente ans. Décrit comme un esprit curieux, il continue à fréquenter les sociétés savantes, dont la Société d'Histoire Naturelle de Toulouse et la Société Astronomique de France. Il donne une partie de ses collections au Musée d'Histoire Naturelle de Bayonne. Certains de ces spécimens sont déjà versé aux collections de la Faculté des Sciences de Toulouse avant 1920. Il est le père de Fernand Daguin (1889 - 1948), un géologue français.

Petit-fils du professeur de la Faculté des Sciences de Toulouse Pierre-Adolphe Daguin(1814-1884), et fils de l'érudit naturaliste Emile Daguin(1844-1830), Fernand suit ses ancêtres dans la voie de la sciences. Il soutient, sous la direction de Charles Jacob, en 1913 l'un des premiers Diplôme d'Etudes Supérieures du laboratoire de géologie. Son mémoire porte sur "Études Géologiques de la région de Tercis (Landes)". Il devient membre la même année de la Société d'Histoire Naturelle de Toulouse, dont il reste correspondant alors que sa carrière l'amène vers le Maroc puis vers l'Aquitaine. Il prend la chaire de Géologie de Bordeaux en 1929 et l'occupe jusqu'à sa mort dans un crash d'avion le 31 juillet 1948, entre Fort de France et Bordeaux.