En 1854, l'abbé Roucou fonde à Massac la Congrégation des Filles de Jésus dont la finalité est le « dévouement aux âmes pauvres et nécessiteuses ». Vers 1859, les premières religieuses assurent l'instruction gratuite aux enfants des alentours et la communauté est reconnue en 1874 comme « Congrégation Hospitalière et Enseignante ». Trois ans plus tard, elle ouvre une école primaire dont la direction est confiée à un personnel laïque désigné par les religieuses dirigées par Mère Stanislas Anouilh (1874-1922). La sainte patronne de l'établissement est sainte Germaine de Pibrac.
Entre 1900 et 1905, plusieurs salles de classe sont construites par les religieuses et, en 1905, malgré la Loi de Séparation des Eglises et de l'Etat, l’école privée continue à fonctionner. Elle assure le cours complémentaire, même pendant la Première Guerre mondiale.
En 1952, l'école Sainte-Germaine devient cours secondaire et dix ans plus tard elle passe sous « contrat simple » avec l’État. En 1966, bénéficiant du rattachement du collège dirigées par les Soeurs de la Croix, l'établissement est agrandi. Trois ans plus tard, il passe sous contrat d'association avec l’État. Il faudra attendre 30 ans pour la direction de l'établissement soit confiée à un laïc nommé par la supérieure de la Congrégation.
En 2009, alors que le lycée a fermé depuis dix ans, les locaux du collège sont rénovés. Cependant, la communauté religieuse demeure et poursuit son activité
