La chapelle est commandée par la famille Vilar, famille noble et fortunée dont un membre (François) avait été sous l'Ancien Régime procureur général au Conseil Souverain du Roussillon.

La chapelle dédicacée à saint Jean est construite contre les remparts et la tour de la famille, dans un style néo-gothique en 1855. Le brouillon d'une lettre de Philippe Vilar daté 28 décembre 1855, mentionne la consécration de la chapelle par Philippe Gerbet, l’évêque de Perpignan.

Le 3 juillet 1887, " renouvellement de l'indulgence plénière de l'autel privilégiée de la chapelle domestique de Mr'Edmond de Vilar".