L’église dédiée à Sainte-Eulalie de Villela apparait dans un texte de 939 mentionnant Rigarda, où un don de vignes et de constructions fut effectué à l’abbaye de Saint-Michel de Cuxa par la vicomtesse Ermesinda. En 1144, l’église fait l’objet d’une donation au prieur et à Notre-Dame de Serrabone par l’évêque Udalger, ce qui permis d’étendre la richesse du prieuré. L’église est reconstruite entre 1150 et 1200 en galets de rivière disposés à certains endroits en opus spicatum. Par ailleurs, des vestiges de scories retrouvés proche de l’édifice indiquent probablement l’existence d’un ancien site minier. En tous les cas, il ne reste aucun vestige de l’église pré-romane.
L'édifice fit fonction d’église paroissiale jusqu’au XVIIe siècle, période de construction de la nouvelle église de Rigarda dédiée à Sainte-Eulalie et Sainte-Julie. C'est à cette époque que le portail roman est déplacé dans l'autre batiment.
