La Villa des Onyx a été édifiée dans la seconde moitié des années 1900 (vers 1908) sous l'impulsion de Jean-Baptiste Loubet (AD Hautes-Pyrénées, 427 E DEPOT 16). Pendant cette période, il occupe le poste de « surveillant comptable » aux carrières de Saint-Béat (AD Haute-Garonne, 1 E 17).
Les dispositions architecturales de cette villa (rez-de-chaussée surélevé, organisation de la façade en travées, escalier central, etc.) sont caractéristiques de cette période. Un soin particulier a été apporté au dessin des linteaux en marbre des fenêtres, de même qu'à l'encadrement de la porte.
La tradition orale rapporte que cette villa était en partie louée aux curistes venant prendre les eaux dans l'un ou l'autre des établissements thermaux de Siradan. Elle était alors divisée en deux logements distincts aménagés dans la hauteur de l'édifice. Il existait ainsi un logement dans la partie ouest et un autre dans la partie est, comprenant chacun trois niveaux.