Le moulin Rigaud est mentionné dès le XVe siècle ; il appartient en 1461 au seigneur de La Livinière, qui l’a acquis de plusieurs propriétaires (les Teisseire et les Salauze de La Livinière, les Camuses de Siran) qui semblent tenir le moulin en alleu au Moyen Âge. Il reste dans les possessions des seigneurs de la Livinière (famille de la Jugie, puis de la Jugie-Merinville) jusqu’à la Révolution, de même qu’un moulin à vent et deux moulins à huile mentionnés aux 17e et 18e siècles. Il fonctionne avec une paire de meules avant la Révolution (mentions en 1615, 1662 et 1750) puis à deux paires de meules au 19e siècle.
Le moulin est acquis par le citoyen Bonny lors de sa vente comme bien d’émigrés à la Révolution. Il est cédé en 1805 pour la somme de 4000 francs à Antoine Mirepoix, qui acquiert en même temps le moulin à vent. La famille Mirepoix loge au moulin Rigaud et continue à le faire fonctionner jusqu’en 1875. Elle exploite le moulin à vent jusqu’en 1879, avant de se reconvertir définitivement dans l’agriculture. Tout au long du 19e siècle, les meuniers du moulin Rigaud sont en conflit avec les propriétaires de parcelles voisines en raison de conflits liés à l'irrigation.
L’édifice a été largement remanié aux 19e et 20e siècles. Aucun vestige ne semble antérieur au 18e siècle. Un corps de logis ainsi qu’un cellier avec chai ont été accolés à la fin du 19e siècle au corps de bâtiment que constitue l’ancien moulin. Un hangar a été construit au 20e siècle à l’emplacement de l’ancien réservoir.