Le monastère de Pessan est cité pour la première fois en 817. Du fait de l'existence ancienne de ce monastère, il est probable qu'une population se soit agglomérée assez tôt sur la colline qui l'entoure. Le village apparaît dans la documentation écrite en 1251 dans la demande d'indulgences faite à l'archevêque d'Auch suite à l'incendie qui aurait détruit le monastère et le bourg : ""cum igitur monasterium et totum castrum de Pessano sit igne combustum"" (Brugèles, preuve de la 2e partie, p. 38). Des coutumes auraient été octroyées aux habitants vers 1270 par l'abbé, seigneur du lieu. Le texte de ces coutumes n'est pas conservé.£Les éléments bâtis les plus anciens observés, hormis l'église, remontent à la seconde moitié du 13e siècle. Il est probable que le village ait été édifié en grande partie à cette période. Il a peu évolué, dans sa morphologie générale, jusqu'au 20e siècle.£Au Moyen Age, le village de Pessan faisait partie du comté d'Astarac. Il avait alors une certaine importance puisque des actes des comtes d'Astarac y ont été rédigés.