L'aqueduc de Fenouillet, situé en amont de l'écluse n°3 de Fenouillet, à 7,536 kilomètres de l'écluse de descente en Garonne aujourd'hui disparue, participe depuis 1844 à la gestion des eaux du canal qui passaient par le déversoir de fond situé en aval de l'écluse, puis sous le ponceau attenant et étaient dirigées par les contre-fossé jusqu'à cet ouvrage d'art. Il est probable que l'entrepreneur Jouet qui a réalisé les travaux du site d'écluse n°3 a également construit cet aqueduc. Le déversoir de fond ayant été obstrué à une date inconnue, les seules eaux qui rejoignent l'aqueduc qui les évacue rive gauche dans le canal de fuite, sont celles qui proviennent du contre-fossé rive droite. Dans l'état descriptif de 1863, l'"aqueduc de Fenouillet" est ainsi décrit : le "mode de construction en nature des matériaux" est "comme à l'aqueduc de Maltemps décrit au N°9, "la fondation des pieddroits a 0.10 de retraite. Le radier de forme circulaire et concave a sur l'axe 0.10 de flèche. L'épaisseur des radiers et fondations varie de la manière suivante à partir de la tête d'amont, de 2.03 sur 2.95 de longueur. Sur l'axe l'épaisseur est de 0.10 de moins sur toute la longueur de l'aqueduc". L'aqueduc présente une ouverture en plein cintre de 4 m de large et mesure 42,90 m de long. L'aqueduc est, de nos jours, recouvert par la végétation.