L'église Saint-Pierre de Marcel est citée vers 960 dans le testament de l'évêque de Toulouse. On en trouve également mention vers 1538 dans les archives du diocèse ainsi que de son annexe, l'église Saint-André de Paulel. Incendiée par les huguenots au mois de février 1570, elle sera reconstruite. Presque 30 ans plus tard, en 1596, le cardinal de Joyeuse la visitait. Le clocher est détruit en 1727 et le curé se plaint en 1729 que l'église soit ouverte aux quartre vents. Il sera reconstruit au mois de juin de la même année par le charpentier Jean Gayral et maçon Jean Lourmière. La visite pastorale du 26 mai 1749 décrit une église dans un état moyen, couverture à moitié par une voûte et à moitié par un plancher.£Au début du 19e siècle, commencent d'importants travaux de réparation et en 1868, des travaux d'urgence sont votés pour éviter que la voûte ne s'effondre. C'est l'architecte département Moynet qui rédige le cahier des charges des travaux dont le montant est estimé à 2.217 Francs. C'est vraissemblablement à l'occasion de ces travaux que 15 verrières sont commandées au peintre-verrier Amédée Bergès. En 1879, le décor peint de l'église est commandé au peintre Arsène Robert (1830-1895). On commande des autels à la fabrique Virebent (1872) et le chemin de crois à la fabrique Giscard (1890) avant d'agrandir le presbytère (1898).