L'Hôtel des Thermes, qui se trouvait à l'est de l'établissement thermal primitif, a selon toute vraisemblance été construit dans la seconde moitié du 19e siècle. Les cartes postales éditées pendant la première moitié du 20e siècle permettent de connaître les dispositions architecturales de la façade donnant sur la route de Saint-Gaudens : l'édifice s'élevait sur quatre niveaux ; les baies formaient cinq travées et possédaient des encadrements en pierre de taille. Ces documents iconographiques indiquent aussi que l'hôtel abritait un café dans la partie sud du rez-de-chaussée.
Lappellation « Hôtel des Thermes » ne figure pas dans les guides et les notices publiés au cours du 19e siècle. Il semble donc que cet établissement ait pris ce nom seulement à partir du début du 20e siècle. Deux hôtels figurant dans ces documents n'ont pas pu être identifiés lors de l'étude de la station thermale d'Encausse-les-Thermes. Il sagit de l'Hôtel de Paris et de l'Hôtel de France. Il est fort probable que l'un deux corresponde à cet édifice.
Celui-ci a été reconstruit au cours des années 1960, vraisemblablement à linitiative de la municipalité. Au début de la décennie suivante, il a été acquis par la Mutuelle Générale des Personnels des Organismes du service public de la Radiodiffusion - Télévision française (ORTF), en même temps que l'établissement thermal. Jusqu'à la fermeture du centre de vacances de la Mutuelle Générale en 1997, il a continué à servir de logements aux touristes. Il abrite aujourd'hui l'épicerie du village ainsi que des logements locatifs.