Le temple primitif de Gajan est construit en 1657 puis démantelé en 1663. L’érection d’un nouveau lieu de culte dans cette commune à majorité protestante est avancée dès 1816. En 1830, le pasteur Samuel Vincent, propriétaire de l’ancien château de la famille d’Albenas construit au XIVe siècle, accueille le culte dans l’une des salles basses.
La mairie obtient l’autorisation d’acquérir cette salle ainsi qu'une pièce à l’étage pour le logement du pasteur en 1832 (3800 francs). La communauté protestante participe à cet achat par une souscription volontaire de 2000 francs. Le géomètre Nolhac estime la valeur de l’ensemble de la maison à 6000 francs.
En 1841, le local du temple est trop étroit pour accueillir l’ensemble des fidèles. La commune achète alors une seconde salle dans son prolongement pour l’agrandir (partie ouest voûtée d'arêtes). Un clocher est construit en 1892. En 1895, Alphonse Roque, aménage l’entrée du temple. Les façades et la toiture sont restaurées en 1995.