La chapelle qui se trouve dans le parc thermal de l'ancienne station de Ganties-Couret a été bâtie entre 1843 et 1846 par le second propriétaire de l'établissement des bains de Couret, M. Barie. Elle aurait été bénie le 8 septembre 1846 par le curé-doyen d'Aspet, lors de la fête de la nativité de la Vierge, prenant ainsi le nom de Chapelle Notre-Dame des Bains.
En août 1846, dans une lettre à l'archidiacre de Saint-Gaudens, le curé-doyen d'Aspet décrit avec précisions les dispositions architecturales de la chapelle : elle « présente dans l'intérieur un carré parfait de six mètres, moins quelque chose de côté. Elle est close au Nord-Est par un mur d'un mètre de hauteur et par une claire-voie qui va jusquau plafond. Hors cette clôture se trouve un péristyle de deux mètres de profondeur. ( ) Les murs ainsi que le plafond sont couverts d'une couche de plâtre » (cf. Dumail, Les églises du diocèse du Comminges, p. 74).
Une vue d'artiste de la station thermale, datant vraisemblablement du début des années 1870, figure l'extrémité nord de l'élévation ouest de la chapelle. Sur cette représentation l'édifice paraît plus imposant et richement décoré. Il est doté d'une ouverture sous arc en lancette, ornée de colonnettes couronnées de chapiteaux sculptés. Il est peu probable que cette vue poétique de la station thermale représente avec fidélité les dispositions architecturales de la chapelle dans le troisième quart du 19e siècle. En effet, la brochure dans laquelle figure cette illustration qualifie quant à elle l'édifice de « rustique » (cf. Filhol, Notice sur les eaux minérales , p. 2). Les dispositions actuelles suggèrent toutefois que cet édifice a subi des modifications importantes au niveau de sa façade nord, puisque le mur gouttereau ouest se termine par des pierres d'attente.