Une première église est mentionnée à Unzent en 1375 comme relevant du diocèse de Pamiers. Un castrum est déjà attesté en 1263. Il est très vraisemblablement étendu autour de la butte sur laquelle est l'église. Cette butte, haute de 6 à 8 mètres, de forme ovale et dont la plate-forme sommitale a été aplanie, est artificielle. Elle est entourée de fossés encore très visibles aujourd'hui tant sur le site que sur le cadastre. Le cadastre de 1778 les décrit comme ""les fossés dudit fort"". Cette butte pourrait être une ancienne motte castrale, bien qu'aucun document ne mentionne un château à cet emplacement au cours du Moyen-Age. La présence de céramiques médiévales sur cette butte et dans les fossés semblent indiquer qu'il s'agissait d'un village ecclésial. Le cimetière devait être également primitivement à cet emplacement. Les principales élévations de l'église pourraient dater du 14 siècle. L'encadrement de pierre de taille et brique du portail de l'élévation sud, à ébrasement à ressauts et couvrement en arc brisé pourrait être daté du 14e siècle, ainsi que les élévations de la nef aux baies hautes et étroites. La présence généralisée d'un enduit cimenté sur l'ensemble des élévations rend difficile une analyse de la mise en oeuvre des matériaux tout comme de possibles remaniements. A cette période médiévale appartiennent l'arc triomphal du choeur et de la chapelle latérale nord avec ses deux culots en pierre de taille calcaire à décor végétal et géométrique. L'édifice a été repris postérieurement, vraisemblablement au 17e puis au 18e siècle. Le clocher-mur pourrait être lié à cette campagne de reconstruction. La double génoise en brique courant sur les élévations du choeur et de la nef, tout comme la quadruple génoise de l'élévation nord de la chapelle latérale, pourrait dater de cette dernière période. La tribune d'orgue en bois, au revers de la façade occidentale, semble dater du 18e siècle. La sacristie attenante au choeur sur l'élévation sud date très vraisemblablement de la 2e moitié du 19e siècle. Les fausses voûtes d'ogives en plâtre sur lattis de bois qui ornaient la nef et le choeur ont été détruites vers 1954 pour laisser place au plafond en bois actuel. Sol du choeur refait au début des années 1980 tout comme les contreforts partiellement renforcés. Le cimetière actuel a été aménagé au début du 19e siècle. Il figure déjà sur le cadastre napoléonien.